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Lopera-Barrero,N. Mauricio; Pereira-Ribeiro,Ricardo; Aparecido Povh,Jayme; Vargas,Lauro; Bespalhok Jacometo,Carolina; Gomes,P. Cristina. |
Modificaciones ambientales derivadas principalmente de acciones humanas han causado la disminución y desaparición de varias poblaciones de peces. Para minimizar este impacto se aplican programas de repoblamiento en varios estados brasileños. Sin embargo, sin la adecuada evaluación estos programas pueden producir cambios genéticos en las poblaciones de peces nativos. Por tanto, el objetivo de este estudio fue analizar la diversidad genética de lotes de Piaractus mesopotamicus usados en programas de repoblamiento, mediante el marcador molecular RAPD. Se analizaron 120 reproductores en cuatro estaciones de piscicultura ubicadas en las ciudades de Sapopema (S), Cornélio Procópio (CP), Cambará (C) y Londrina (L), en el estado del Paraná, Brasil. Los resultados... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genética de la conservación; Peces; Piaractus mesopotamicus; RAPD; Repoblamiento; Variabilidad genética. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952009000300004 |
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Mota,José Hortêncio; Souza,Rovilson José de; Yuri,Jony Eshi; Resende,Geraldo Milanez de; Paiva,Luciano Vilela. |
Realizou-se este estudo com o objetivo de determinar a diversidade genética entre doze cultivares de alho, por meio de marcadores moleculares RAPD. Foram utilizados seis cultivares nobres e seis cultivares seminobres. A análise de agrupamento das similaridades genéticas foi realizada pelo método UPGMA, gerando um dendrograma utilizando o índice de Jaccard. Houve a formação de dois grupos, sendo o primeiro grupo formado pelas cultivares nobres (Roxo Pérola de Caçador, Chonan, Contestado 12, Caçador 30, Caçador 40 e Quitéria 595), ou seja, cultivares que precisam de vernalização para a formação do bulbo, e um segundo formado pelas cultivares seminobres (Gigante Curitibanos, Gigante Roxo, Gigante Roxão, Gravatá, Amarante e Cateto Roxo) ou que não precisam de... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Allium sativum; RAPD; Cultivares; Divergência genética. |
Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542004000400006 |
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Gomes,Patrícia Cristina; Ribeiro,Ricardo Pereira; Sirol,Rodolfo Nardez; Lopera-Barrero,Nelson Maurício; Moreira,Heden Luiz Marques; Povh,Jayme Aparecido; Mangolin,Claudete Aparecida; Vargas,Lauro; Jacometo,Carolina Bespalhok; Streit Júnior,Danilo Pedro. |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de um estoque de Salminus brasiliensis utilizado em programas de repovoamento do rio Paranapanema, por meio do marcador RAPD. Dez reprodutores (cinco machos e cinco fêmeas) e sua progênie (40 larvas e 40 alevinos) foram analisados. Os oito iniciadores analisados produziram 96 fragmentos, dos quais 81,2% foram polimórficos. Houve diferença significativa na frequência de 32 dos 96 fragmentos, com a presença de um fragmento exclusivo nos alevinos. O índice de Shannon, a percentagem de fragmentos polimórficos e a distância e a identidade genética mostraram menor divergência genética entre os reprodutores e as larvas, além de diminuição da variabilidade nos alevinos. A divergência genética foi menor... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Salminus brasiliensis; Marcador molecular; Peixe; RAPD; Programas de repovoamento. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000200008 |
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Lopes,T.S.; Streit Jr.,D.P.; Ribeiro,R.P.; Povh,J.A.; Lopera-Barrero,N.M.; Vargas,L.; Pinto Filho,C.; Queiroz,J.R.. |
Analisou-se a diversidade genética de estoques de reprodutores de Tambaqui (Colossoma macropomum), mediante o uso de marcador RAPD, utilizando-se 10 primers para analisar 30 amostras do estoques de reprodutores das pisciculturas de Boa Esperança e Vale Verde, localizadas no Estado de Rondônia. A porcentagem de fragmentos polimórficos e o índice de diversidade genética de Shannon foram altos nos dois estoques de reprodutores. O estoque de reprodutores de Boa Esperança apresentou um fragmento exclusivo. A diferenciação genética foi baixa e o número de migrantes por geração foi alto entre os estoques de reprodutores. O dendrograma não separou os indivíduos dos estoques de reprodutores em grupos distintos. Há alta variabilidade genética nos estoques de... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Tambaqui; Colossoma macropomum; RAPD; Variabilidade genética; Monitoramento genético. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352009000300029 |
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Magalhães,Marcelo; Martinez,Romari Alejandra; Gaiotto,Fernanda Amato. |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de estoques comerciais do camarão Litopenaeus vannamei, por meio de marcadores RAPD e diferentes métodos estatísticos de análises, em Canavieiras, BA. Vinte primers foram utilizados para a obtenção de 59 marcadores polimórficos. A análise com o programa AMOVA evidenciou diferenciação genética significativa entre os estoques, com fiST = 0,186 (p<0,001). Entretanto, as análises obtidas com o programa HICKORY sugeriram não existir estruturação (<FONT FACE=Symbol>q b</FONT > ou = 0,002), mas considerável taxa de endogamia dentro dos estoques, em razão, provavelmente, do cruzamento entre indivíduos geneticamente mais similares (f = 0,729). Testes com bootstrap mostraram 48 como o... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Marcadores moleculares; Variabilidade genética; Aqüicultura; RAPD. |
Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000800009 |
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Povh,Jayme Aparecido; Ribeiro,Ricardo Pereira; Sirol,Rodolfo Nardez; Streit Júnior,Danilo Pedro; Lopera-Barrero,Nelson Mauricio; Vargas,Lauro; Gomes,Patrícia Cristina; Lopes,Taís da Silva. |
O objetivo deste trabalho foi estudar a diversidade genética das amostras de pacu do médio Rio Paranapanema e do estoque de reprodutores utilizado no programa de repovoamento da Estação de Aqüicultura e Hidrologia da usina hidrelétrica Duke Energy, por meio do marcador RAPD. Foram utilizados 14 primers para analisar 30 indivíduos capturados no médio Rio Paranapanema e 29 indivíduos do estoque de reprodutores. O índice de diversidade genética de Shannon e a percentagem de fragmentos polimórficos foram superiores nos indivíduos capturados do Rio Paranapanema. A similaridade genética foi maior nos indivíduos do estoque de reprodutores. A análise da variância molecular mostrou que a maior parte da variação está dentro de cada grupo (84,2%) e não entre os... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Piaractus mesopotamicus; RAPD; Marcador molecular; Variabilidade genética. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000200007 |
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Gomes, Patricia Cristina; UEM; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM; Barrero, Nelson Lopera; UEM; Povh, Jayme Aparecido; UEM; Vargas, Lauro; UEM; Sirol, Rodolfo Nardez; Duke Energy International Geração Paranapanema. |
Recentemente a produção aquícola brasileira tem apresentado grande progresso. Dentre as espécies nativas cultivadas no Brasil, a piapara (Leporinus elongatus) tem sido amplamente preconizada. Com objetivo de avaliar os programas de repovoamento, foram analisadas a variabilidade e a divergência genética de três estoques de piapara com a técnica de RAPD (Random Amplified Polymorphic). O primeiro estoque pertence à Estação de Aquicultura e Hidrologia da Duke Energy International (A); o segundo, à piscicultura de Rolândia (B) e o terceiro, ao Programa de Repovoamento dos Rios do Paraná (C). Os dez primers para RAPD utilizados produziram 105 fragmentos polimórficos, conferindo um polimorfismo de 98,1% para os três estoques avaliados. A porcentagem de locos... |
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Palavras-chave: 5.05.04.00-2 Reprodução Animal divergência genética; Locos polimórficos; Peixe; RAPD; Reprodutores; Variabilidade genética. genetic divergence; Polymorphic loci; Fish; RAPD; Reproducers; Genetic variability. |
Ano: 2008 |
URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/4710 |
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Almeida,Mariana Castro da Costa; Chiari,Lucimara; Jank,Liana; Valle,Cacilda Borges do. |
A utilização de marcadores moleculares pode servir para direcionar cruzamentos, confirmar novos híbridos e identificar genótipos para fins comerciais. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum usando marcadores moleculares do tipo RAPD (Polimorfismos de DNA amplificados ao acaso). Foram 22 genótipos analisados com 10 primers, os quais amplificaram 178 fragmentos polimórficos de DNA, que foram usados para estimar a similaridade genética por meio do coeficiente de Jaccard. Os valores de similaridade obtidos variaram de 0,066 a 0,841. A estrutura genética entre todos os genótipos estudados foi estimada pelo método UPGMA (Método de agrupamento com médias... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Brachiaria spp.; Forrageiras; Marcadores moleculares; Panicum maximum; RAPD. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011001100024 |
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Silva,Cristiane Maria da; Hinz,Robert Harri; Stadnik,Marciel João; Pereira,Adriana; Tcacenco,Fernando Adami. |
O mal-do-panamá, causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC), é um dos principais problemas fitossanitários da bananicultura. O uso de cultivares resistentes é o método preferencialmente recomendado para o seu controle, sendo a avaliação da diversidade genética do patógeno necessária no desenvolvimento de estratégias de manejo da doença a longo prazo. Assim, este trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade genética de isolados de FOC por marcadores moleculares RAPD e SSR. Foram avaliados 64 isolados coletados em regiões produtoras do estado de Santa Catarina, sendo que 100% deles foram patogênicos à bananeira da cv. 'Enxerto'. As análises de conglomerados com esses marcadores revelaram variabilidade entre os isolados amostrados. As técnicas... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Banana; Doença; Fungo; RAPD; SSR. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010001200007 |
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Dupont, S.; Carre-mlouka, A.; Descarrega, F.; Ereskovsky, A.; Longeon, A.; Mouray, E.; Florent, I.; Bourguet-kondracki, M. L.. |
The diversity of the cultivable microbiota of the marine sponge Phorbas tenacior frequently found in the Mediterranean Sea was investigated, and its potential as a source of antimicrobial, antioxidant and antiplasmodial compounds was evaluated. The cultivable bacterial community was studied by isolation, cultivation and 16S rRNA gene sequencing. Twenty-three bacterial strains were isolated and identified in the Proteobacteria ( or classes) and Actinobacteria phyla. Furthermore, three different bacterial morphotypes localized extracellularly within the sponge tissues were revealed by microscopic observations. Bacterial strains were assigned to seven different genera, namely Vibrio, Photobacterium, Shewanella, Pseudomonas, Ruegeria, Pseudovibrio and... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Antimicrobial activity; Antioxidant activity; Antiplasmodial activity; Associated bacteria; Phorbas tenacior; Phylogenetic diversity; RAPD; Sponge. |
Ano: 2014 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00372/48276/48535.pdf |
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Freire,Laurineide Lopes de Carvalho; Costa,Ana Bolena Lima da; Góes,Larissa Brandão; Oliveira,Neiva Tinti de. |
Five mutants (MaE10, MaE27, MaE24, MaE41 e MaE49) of Metarhizium anisopliae wild strain E9 were analysed for DNA profile through the RAPD technique and for changes in total protein content by spectrophotometry, polyacrylamide gel electrophoresis and densitometry. The pattern of RAPD markers showed genetic polymorphism among the strains: out of twenty primers seven were selected, producing 113 bands. Forty seven bands were present in all strains (41.6% of monomorphic bands) and 66 showed polymorphism (58.4%). The mean coefficient of similarity among all strains was 0.75 (75%). The total protein content varied, staining in the interval of 6.0-8.0 µg/µl. The electrophoresis analysis, through zymogram and protein fraction profiles by densitometry, allowed the... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Metarhizium anisopliae; Mutants; RAPD; Total protein. |
Ano: 2001 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822001000200004 |
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Saleh,Basel. |
The goal of this study was to investigate the molecular characterization of A. macrostachyum genotypes grown in the Western coast of Syria using RAPD and ISSR techniques. PCR amplifications with 20 RAPD primers gave an average of 9.25 selected markers/ primer, with a maximum of 17 (OPG05) and a minimum of four (OPA02). Percentage of polymorphic bands ranged from 40 to 100% according to RAPD primers tested. Among the 185 selected bands, 160 (84.96%) were polymorphic. The amplification with seven ISSR primers generated 88 bands, and 80 (90.91%) were polymorphic. (CA)8RG and (AG)8GTG ISSR primers tested in this study yielded highly informative patterns. RAPD and ISSR fragment sizes ranged from 0.2-3 kb. Based on this study, the use of RAPD and ISSR... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: A. macrostachyum; Genetic diversity; Genotype; ISSR; Polymorphism; RAPD. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132011000500002 |
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Lanteri,Analía A.; Confalonieri,Viviana A.; Scataglini,M. Amalia. |
Después de diez años del primer registro del picudo del algodonero, Anthonomus grandis Boheman (Coleoptera, Curculionidae), en la Argentina, el insecto ha llegado a la zona algodonera del Chaco. Los estudios moleculares realizados sobre poblaciones de la Argentina, Brasil y Paraguay, y posibles poblaciones fuente de EE.UU y México, han aportado información relevante para el control de la plaga. Se aplicaron las técnicas de RAPD (Polimorfismos del ADN Amplificados al Azar) y de secuenciación de los genes mitocondriales de la Citocromo Oxidasa I y II, las cuales permitieron identificar dos linajes principales de picudos: a) linajes con escasa o nula variabilidad medida en términos de heterocigosis y diversidad haplotípica, considerados colonizadores... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Picudo del algodonero; ADN mitocondrial; RAPD; Argentina; Variabilidad poblacional; Linajes ancestrales y colonizadores recientes. |
Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0373-56802003000200001 |
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